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Sobre

Sou um bioinformático especializado em tecnologias genômicas, sequenciamento de nanoporos em tempo real, análise de sinais, aprendizado de máquina e hardware associado. Tenho experiência em desenvolvimento de software e mais de uma década de experiência na indústria de patologia.
 

Liderando o desenvolvimento computacional no Grupo de Tecnologias Genômicas do Center for Population Genomics no Garvan Institute of Medical Research, aplico minhas habilidades únicas para desenvolver novas ferramentas de bioinformática, bem como projetar e apoiar a infraestrutura de sequenciamento de nanoporos.

Minhas áreas de pesquisa incluem:

  • Análise de sinal de nanoporos

  • Testes clínicos e desenvolvimento de métodos

  • Distúrbios de repetição curta em tandem

  • Genômica viral (HIV/SARS-Cov-2)

  • Sequenciamento de célula única

  • Sequenciamento Direto de RNA

  • Montagem do genoma

  • Detecção de metilação

  • Aprendizado de máquina/profundo

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Experiência

Instituto Garvan / Analista de Sistemas Genômicos

Junho de 2017 - PRESENTE,  Darlinghurst

Cerebro Biosystems / Cofundador e CTO

Outubro de 2017 - PRESENTE,  Darlinghurst

Healius (Saúde Primária) / Sênior Desenvolvedor de software 

Dezembro de 2017 - PRESENTE,  St Leonards

Instituto Garvan / Assistente de Pesquisa

Dez de 2016 - Junho de 2017,  Darlinghurst

Atenção Primária à Saúde / Analista Programador

Junho de 2015 - junho de 2017,  St Leonards

Patologia de Douglas Hanly Moir / Auxiliar de Laboratório

2011 - 2015,  Macquarie Park

Davies Campbell De Lambert/Healthscope Pathology/Laboratório

2009-2011,  Ryde

Prêmios

  • 2020 - Prêmio de pôster em segundo lugar - London Calling

  • 2019 - Prêmio Lighting Talk - ABACBS/GIW

  • 2018 - Prêmio Palmer Innovation - Prêmio Garvan

  • 2017 - Prêmio J&J - Med Tech's Got Talent

  • 2017 - Prêmio Garvan: Por ir 'acima e além' no apoio à cultura de bioinformática na Garvan

  • 2017 - Prêmio de cartaz de última hora - Conferência AGTA

Habilidades

  • Linux/UNIX, BASH

  • Python, programação estatística R, C, AHK, SQL

  • projeto de algoritmo

  • Computação de Alto Desempenho (SGE)

  • Bioinformática, ciência de dados

  • administração do sistema, automação, rede,\

  • Sistemas de Informação Laboratorial (LIS)

Contato
Em formação

Grupo de Tecnologias Genômicas
Centro de Genômica Populacional

Instituto Garvan de Pesquisa Médica

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©2022 por James M. Ferguson. Criado comWix.com

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